Number of segment pairs = 132; number of pairwise comparisons = 66 '+' means given segment; '-' means reverse complement Overlaps Containments No. of Constraints Supporting Overlap ******************* Contig 1 ******************** 16842504+ 16807405+ is in 16842504+ 16807507+ 16807513+ is in 16807507+ 16842526+ 16842524+ is in 16842526+ 16807488+ is in 16842524+ 16807531+ is in 16842524+ 16807428+ is in 16842524+ 16842486+ is in 16842524+ 16807650+ 16807555+ is in 16807650+ DETAILED DISPLAY OF CONTIGS ******************* Contig 1 ******************** . : . : . : . : . : . : 16842504+ ATACCGCTTCTCTCTTCGTCCATAATGGCAATCATCTCCTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807405+ TTCTCTCTTCGTCCATAA-GGCAAT-ATCTC-TGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807507+ CTGCTTCAATAGCAGCCCTGCA 16807513+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16842526+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16842524+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807488+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807531+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807428+ CTGCTTCAATAGCAGCCCTG-A 16842486+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807650+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A 16807555+ CTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A ____________________________________________________________ consensus ATACCGCTTCTCTCTTCGTCCATAATGGCAATCATCTCCTGCTTCAATAGTAGCCCTG-A . : . : . : . : . : . : 16842504+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCTCTATTTC 16807405+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807507+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTCC 16807513+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGGGCCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16842526+ ACGTATAAACAAACTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCTCTATTCC 16842524+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807488+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807531+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807428+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGGCAGCCTCTATTCT 16842486+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807650+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- 16807555+ ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- ____________________________________________________________ consensus ACGTATAAACAAATTAAAATATACAGGG-CCTAAACAATAAAATAGG-AGTCT-TATTT- . : . : . : . : . : . : 16842504+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16807405+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16807507+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTGTAGA-C 16807513+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16842526+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGCCCAGACTCATGAATATCATATATG-AGA-C 16842524+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16807488+ TAATGAAATTCATC-TTACCG 16807531+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTGAGGAAC 16807428+ TAATGAAATTCATCCTTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16842486+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16807650+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C 16807555+ TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C ____________________________________________________________ consensus TAATGAAATTCATC-TTACCGTCTTACGGTCCAGACTCATGAATATCATATTTG-AGA-C . : . : . : . : . : . : 16842504+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16807405+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGAT 16807507+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16807513+ CCAGAAAGTATCCA 16842526+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16842524+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16807531+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTG 16807428+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16842486+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16807650+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT 16807555+ CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT ____________________________________________________________ consensus CCAGAAAGTATCCACCCTATACTTTGTGTGTTGATTAGGGCTGGAAAAAAAGCTCGAGCT . : . : . : . : . : . : 16842504+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16807507+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16842526+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16842524+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16807428+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16842486+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16807650+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA 16807555+ CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA ____________________________________________________________ consensus CGACGAGCTGGCTCGGGCTCGCAGCAGCTCGGCTCGGCTCGGACCGGCTCAACGCTCCGA . : . : . : . : . : . : 16842504+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16807507+ ACGAGCCCAACCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16842526+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16842524+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16807428+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16842486+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16807650+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG 16807555+ ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG ____________________________________________________________ consensus ACGAGCCCAAGCCGAGCTTGTTTTTCTGGCTCGTGAAAAGAGCGAGTCAGCTCGGCTCGG . : . : . : . : . : . : 16842504+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGCGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16807507+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16842526+ TTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16842524+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16807428+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16842486+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16807650+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC 16807555+ CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC ____________________________________________________________ consensus CTCGGTGCAGCTCGCGAGCTGGCTCGTGGCTCGACCCAACATAATTTGTTACATAAAATC . : . : . : . : . : . : 16842504+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTCGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16807507+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16842526+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGTCAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16842524+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16807428+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16842486+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16807650+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT 16807555+ TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT ____________________________________________________________ consensus TTAATTAGCATATAATATTAATACCGAGTAGACAATTAATTTATGTTATTTGAGATTACT . : . : . : . : . : . : 16842504+ ATCCAAAAATAAAACTATTCTATATATTATATCTAGTGATGTATCTATTATACTA 16807507+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTAAT 16842526+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTAATTCA 16842524+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-CAGCGATGTATCTATTCTACTAATTCA 16807428+ ATACAAAAATAAT-CTAT 16842486+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTA 16807650+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTAATTTA 16807555+ ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTAATTTA ____________________________________________________________ consensus ATACAAAAATAAT-CTATTTTATATATTATAT-TAGTGATGTATCTATTTTACTAATTCA . : . : . : . : . : . : 16842526+ AAATATTTTTAAGAT 16842524+ AAA 16807650+ AAATATTTTTAAGATTTTATATTATAATTTAGAGAGCAGATTTAATTTTATGCCTAGCTC 16807555+ AAATATTTTTAAGA ____________________________________________________________ consensus AAATATTTTTAAGATTTTATATTATAATTTAGAGAGCAGATTTAATTTTATGCCTAGCTC . : . : . : . : . : . : 16807650+ GGTTGGCTCGGCGAGCCGGCTCGCGAGCCAGAAGCGAGCCGAGCCGAGCCGCTTTTTCGA ____________________________________________________________ consensus GGTTGGCTCGGCGAGCCGGCTCGCGAGCCAGAAGCGAGCCGAGCCGAGCCGCTTTTTCGA . : . : . : . : . : . : 16807650+ GCTC ____________________________________________________________ consensus GCTC